研究院未来发展战略是：保持传统优势以强化特色；拓宽研究领域以促进发展；整合相关资源以优化结构；健全激励机制以提升水平。
研究院发展的目标是：以科学技术史学科为龙头，农业技术哲学、专门史、农村社会学、农业文化、经济法学、农业旅游为重点，科学研究与人才培养并重，文、史、哲、管、法多学科协调发展，力争5-10年将研究院建设成为国际知名的中国农业历史与文化的科学研究中心、人才培养中心、信息资源中心、传播展示中心和学术交流中心。
